Transz embereknél megjelenhet a nemi diszfória.
A nemi diszfória egy olyan kétségbeesett és/vagy disszociációval járó fizikai és/vagy mentális állapot, amelynek oka, hogy a személy nemi identitása és születéskor kijelölt neme eltér egymástól. Diszfóriát okozhatnak a nem társadalmi aspektusai is és az, ahogyan mások reagálnak ránk a nemünk alapján (pl. valaki nem tud azonosulni a nevével, a nemi szerepével). Testi jegyek is okozhatják (pl. a transz férfiakat zavarja a mellük, a transz nőket az ádámcsutkájuk stb.).
A diszfória súlyossága az enyhe kényelmetlenségtől a súlyos szorongásig terjedhet.
A diszfória első jelei kora gyermekkorban jelentkeznek, amikor a gyermek szembesül azzal, hogy tapasztalatai és megélt neme nem illeszkedik a testi jegyeihez. A pubertás különösen felkavaró élmény lehet, a bekövetkező változások gyakran negatív érzéseket keltenek a fiatalban a teste iránt. Ez különösen erős lehet a női testben élőknél a másodlagos nemi jegyek és a menstruáció megjelenésekor.
Fontos tudatában lennünk, hogy nem minden transz identitású személy érzi magát kényelmetlenül a testében, van, aki ki van békülve vele. A nemi diszfória nem betegség, de ha nem foglalkoznak vele és nem veszik komolyan, mentálhigiénés problémákhoz vezethet, mint például szorongásos megbetegedések, skizofrénia, depresszió, szerhasználat, étkezési zavarok és öngyilkossági kísérletek.